c4Lab 的 計算與系統生物學 奇幻之旅

Nowadays, we teach computers to learn skills to achieve some tasks. Computers classify news, filter junk emails, play games, compose music, and even monitor terrorism. In c4Lab, we teach computers biology. Even better, computers learn biology by itself. We call the knowledge organized by computers prediction models, and the information delivered by computers predictions. As the prediction accuracy increases, computational tools provide us with more and more facts about living organisms.

2014年3月17日 星期一

102-2 PDSA HW4

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HW4要讓大家畫畫圖,應該會很有趣! 1. 利用二維座標畫點 [goal] :利用StdRandom產生N個2D points (用Point2D的array來儲存),再搭配StdDraw把這個N個點畫出來(radius= 0.01) 請大家練習使用Point2D這...
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2014年3月10日 星期一

102-2 PDSA HW3

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HW3-1. (30 points) [題目] Write a stack client Parentheses that reads in a text file (file name is specified through standard input, args[0...
2014年3月4日 星期二

BLAST revisit

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上星期(2014/2/26)又到醫學院講述序列比對的重要觀念與操作細節 回想起去年上完課後寫下的 文章 ,把它翻出來與大家分享。 今年,想藉機會進一步討論BLAST的e-values。 讓我們先用以下序列(query)做個試驗: >FASTA format...
2014年3月2日 星期日

102-2 PDSA HW2

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這裡是我做102-2 PDSA HW2的筆記,一共有三個部分: HW2-1 Perform doubling test on 3-sum algorithms 先開啟一個NetBeans Project (需要幫助者,請參考 HW1的筆記 ) 先加入作者的libra...
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2014年2月19日 星期三

如何讓NetBeans IDE進行除錯時看到作者提供的libraries中的程式碼

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上一篇文章提到 如何在NetBeans中開啟一個新專案 ,其中有提到如何加入 Algorithms 一書中, 作者 提供的libraries ( stdlib.jar 與 algs4.jar )。今天來進一步說明一下,加入libraries時,可使用另一種方法,讓NetBean...
2014年2月16日 星期日

102-2 PDSA HW1

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執行NetBeans: 先開一個新的專案: 選Java Application,按Next: 取名字(e.g. HW1),設定專案目錄,不要自動產生Main Class: 新增一個java source檔: 取Class名字: 開...
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2014年2月7日 星期五

NetBeans IDE

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這學期的"資料結構與演算法實務",我希望修課同學能使用Java programming練習所學的資料結構與演算法,為了讓大家(包括我自己)有效學習,絕對需要一個好的開發工具。 今天就先來試試NetBeans IDE,首先,NetBeans官方網頁(http...
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關於我自己

陳倩瑜
Chien-Yu Chen (陳倩瑜) is currently a professor of department of Bio-Industrial Mechatronics Engineering, National Taiwan University. She holds a B.S. degree of Electrical Engineering from National Taiwan University (1996), a M.S. degree of Electrical Engineering from Stanford University (1998), and a Ph.D degree of Computer Science and Information Engineering from National Taiwan University (2003). During the Ph.D program, she initiated the research of Bioinformatics, and has mainly focused on developing algorithms for studying molecular biology. She has been an Assistant Professor of Graduate School of Biotechnology and Bioinformatics in Yuan Ze University from Feb. 2004 to July 2005, where she began her academic career.
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